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发布自主研发可量产新品,「齐碳科技」要实现纳米孔基因测序仪的国产替代

2021-12-11 来源: 36氪 原文链接 评论0条

昨日,纳米孔基因测序上游企业齐碳科技发布了即将量产的纳米孔基因测序仪QNome-3841,以及配套芯片和试剂,并宣布其位于成都天府国际生物城的生产基地竣工。

而随着全新纳米孔基因测序仪的量产,纳米孔测序技术将在更多应用场景中发挥效用,为生命科学及相关领域的研究及应用提供解决方案。

据齐碳科技联合创始人兼首席科学家白净卫博士表示:QNome-3841定位为一款小通量测序仪,8小时可产出1-1.5Gb数据,单次准确率达90%,一致性准确率(50x)达99.9%,公司内部已使用此款设备完成了读长大于300Kb的测序实验。此外,QNome-3841还能为用户提供一站式数据分析平台。

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QNome-3841

据他介绍,这款产品因直接测序、实时、小巧便携等特点,特别适合小型实验室、户外及对时效性要求高的应用场景,“例如临床应用时,可以做到来一个样本测一个样本,无需凑样,可大大缩短测序时间”。

另外,白净卫博士还透露了齐碳科技过去一年里在纳米孔蛋白、生物芯片等核心技术方面取得的突破,譬如最新一代自主研发的K2系列纳米孔蛋白,在没有进行basecall算法的优化下,单次准确率已达到95%;此外研发了基于有机基材和硅基材的两种流体芯片,耗材可拆卸,能有效降低测序成本,同时还完成了自主ASIC芯片设计,全流程国产化生产。

在此之前的2020年9月,齐碳科技发布了自主研发的纳米孔单分子基因测序仪,基于该产品的Alpha Test今年5月正式启动。

齐碳科技联合创始人谢丹博士表示,在Alpha Test阶段,齐碳科技与病原体研究、遗传病研究、肿瘤研究、司法刑侦、动植物保护等领域的头部企业、高校、科研院所等多家机构开展合作,涉及70多个项目,1500多个样本。项目涵盖土壤宏基因组测序、疾病检测、物种鉴定、基因组组装、病毒分型、临床病原检测等。

在这些合作项目中,通过利用纳米孔基因测序仪QNome-9604对大量细菌、病毒和人类基因组样本进行测序,已累计输出800Gb数据。而这些数据也为将来更多的创新研究,提供有力支撑。

据谢丹博士介绍,在Alpha Test阶段,“单张芯片的最大孔数为325、最大数据量产出为1420Mb、最大N50为36Kb,最长reads为290Kb。这也意味着QNome-9604产品的性能和可靠性符合预期,可以满足下游应用端用户的需求。”

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Alpha Test阶段相关数据

随后,他还分享了Alpha Test阶段在血流感染宏基因组检测、细菌基因组组装、法医领域SNP位点测序、肿瘤融合基因检测等6个典型案例,展现了纳米孔基因测序技术在多个应用场景中的优势和广阔的市场前景。

以法医领域为例来看,四川大学华西基础医学与法医学院侯一平教授就指出,全球法医实验室广泛使用DNA检测来侦破刑事案件。DNA测序对序列结构解析的优势有益于法医DNA分析。便携的纳米孔测序仪更加适用于犯罪现场分析,近来也逐渐在法医领域崭露头角。

最后,齐碳科技CEO胡庚博士表示,“当前的技术和产品仅仅是一个开始,未来齐碳将不断加速技术、产品和场景的探究步伐,为用户提供各个场景下‘从样本到结果’的基因测序解决方案。”

延伸阅读

36氪独家|攻克基因测序“卡脖子”技术,齐碳科技获超4亿元B轮融资,鼎晖、高瓴联合领投

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